Molècules & estructures Histones: -(H3+H4)*2 -(H2A+H2B)*2 Nucleosoma

Molècules & estructures

Histones:
-(H3+H4)*2

-(H2A+H2B)*2 Nucleosoma

Replicació

DNAa: força de torsió que obre la doble hèlix per la zona de 3 capses amb
parells de bases A/T i s'uneix a les 4 capses de 9 parels de bases.

SSB: cobreix les xones de DNA monocatenari

Helicasa: va separant les cadenes de DNA i gasta ATP. 2 helicases/ forqueta
de replicació i carregades a la cadena lagging.

Topoisomerasa: evita el superenrotllament, ex: Girasa

Primasa: síntesis de primers (RNA), és una RNApoli i no té especificitat
per cap seqüència. Catalitzada pel contacte amb helicasa.

DNApoli(s) en procariotes

" "Poli "Poli 3-5"Poli 5-3"Funció "
" "5-3 " " " "
"I "v "v "v "Processa els fragments d'Okazaki "
"II "v "v "x "Reparació "
"III"v "v "x "Síntesis de DNA "
"IV "v "x "x "Reparació "
"V "v "x "x "Reparació "

DNApoli en eucariotes:

Alfa: Síntesis de primers
Delta: cadena lagging
Epsilon: cadena lagging o leading
Les dues últimes allarguen cadenes

Ligasa: forma enllaços fosfodièster i segella la cadena

DNApoli III té tres grans parts:
Cor catalític:
-Alfa: activitat 5-3, catalitza l'unió de dNTP a la cadena
-Epsilon: exo 3-5, treu nucleòtids
-O: paper estructural

Complex gamma: carrega anelles Beta que mantenen unita el cor catalític amb
la cadena de DNA. És activat pels primers.
Proteïnes Tau: mantent unit el cor catalític amb el complex gamma.

Reparació:

Fotoreplicases: depenen de la llum. Trenquen els enllaços T-T (els dímers
de timines) formats per l'acció de la radiació.
MUT(en procariotes):

MUTs: detecta si s'han fet aparellaments incorrectes.

MUTl: paper estructural.

MUTh: diferencia les 2 cadenes (la de nova síntesis i l'original) segons
l'estat de metilació i talla l'enllaç fosfodièster del nucleòtid mal
aparellat i fa un nick. Desprès una exonucleasa detecta el nick i treu el
nucleòtid perquè desprès intervinguin DNApoli i ligasa.

En eucariotes MSH=MUTs MLH=MUTl MUTh= no té equivalpencia

Sistema BER (escissió de bases):

DNA glicosilasa: treu la BN lesionada, talla l'enllaç BN desoxiribosa
(existeix una específica per cada lessió).

Endonucleasa: talla el cantó 5 del nucleòtid sense BN.

Fosfodiesterasa: talla el cantó 3 del nucleòtid sense BN i el nucleòtid
s'en va

DNApoli + Ligasa omplen l'espai.

NER (escissió de nucleòtids):

Proteïnes UVR:

A+B: s'ajunten i formen un trímer AAB que gasta ATP i s'uneix a la cadena
de DNA i el recorre. Quan reconeix l'error AA marxen i B pateix un canvi
conformacional que doblega el DNA.

C: s'uneix a B i produeix 2 nicks

D: té propietat helicasa i extreu la cadena amb els nicks.

A continuació actuen DNApoli I + Ligasa.

NER en humans:

TF2H + XPB(5) + XPC (3) són helicases que formen una zona oberta. La cadena
sense lessió queda associada a una SSB.

XPF+XPG tenen activitat endonucleasa i tallen de forma assimètrica perquè
el DNA surti del complex.

A continuació actuen DNApoli I (el seu homòleg en humans) + Ligasa.

https://www.youtube.com/watch?v=9DRnoi8gfMU&list=UUeqvYBT-y38Oy8icqT66MSw

(Aquest vídeo està bé per entendre-ho però també al mateix canal està ple
de material molt interessant per l'assignatura en si)

Recombinació (en prok)

Part central:

RecA: actua en zones de cadena senzilla. Cal : DNA homòleg + DNA d'extrem
lliure.
Es carrega a un lloc amb DNA monocatenari amb SSB. Rec A té més afinitat i
va desplaçant a SSB (reacció cooperativa que augmenta de velocitat a mesura
que Rec A va unint-se al DNA. No existeix cap altra proteïna que pugui fer
la seva funció.

Rec BCD: actua iniciant el procés de recombinació, és un reclam per Rec A.

Fase de recombinació:
Ruv ABC:
4 Ruv A: sostè les entrades, 2 recombinants i 2 no recombinants.
Ruv B: s'uneix a la sona de sortida de l'heterodúplex
Ruv C: té activitat endonucleasa.
En eucariotes Rec A= Rad 51 o DmC1

En negreta estan els complexos, en vermell proteïnes o complexos amb
activitat catalítica o amb alguna acció concreta (per així dir-ho) i en
verd proteïnes o complexos amb funció estructural.